제품 소개
Megaruptor는 Long-read sequencing을 위한 DNA Shearing 장비로, PacBio®, Oxford Nanopore®, Illumina®, Ion Torrent™ 등 다양한 시퀀싱 플랫폼에 최적화된 대용량 DNA 단편화 솔루션입니다.
Feature
- 2 kb~75 kb 범위에서 원하는 크기로 DNA Shearing 가능하며, target size fragment의 높은 distribution 형성
- Syringe pump 제어 방식을 통한 정교한 DNA fragmentation
- 일회용 소모품 사용으로 샘플 간 Cross-contamination 차단
- 2개 시료를 별도 Recalibration 없이 연속 자동 처리
- Tubing 막힘 현상을 개선하고 전용 컴퓨터가 기본 탑재된 소프트웨어 제어 시스템
- 자동 세척(System washing) 기능 내장으로 실험 간 간편한 관리
- 재현성 높고 간편한 전용 프로그램 제공
응용분야
- Long-read sequencing(PacBio®, Oxford Nanopore®) 전처리
- Short-read/Mid-range sequencing(Illumina®, Ion Torrent™) 전처리
- 대용량 genomic DNA(gDNA) 절편화 및 라이브러리 제작
FAQ
Q1.기존 Sonication 방식이나 일반 Shearing 기술 대비 Long-read sequencing에 있어 어떤 장점이 있나요?
A.Megaruptor는 Syringe pump 방식을 기반으로 3 kb부터 최대 75 kb까지 긴 길이의 DNA를 손상 없이 정교하게 Shearing할 수 있습니다. 타겟 크기(Target size)의 Fragment distribution이 매우 좁고 일정하여 PacBio®나 Oxford Nanopore® 등 Long-read 시퀀싱 플랫폼에 최적화된 고품질 라이브러리 결과를 제공합니다.
Q2.권장하는 DNA 샘플의 용량, 농도 및 전용 용기 조건은 어떻게 되나요?
A.샘플 부피는 최소 50 μL에서 최대 400 μL(권장 200 μL)까지 처리가 가능합니다. 샘플 농도는 0 ~ 50 ng/μL 범위(권장 농도 200 ng/μL)를 지원하며, 0.5 mL 전용 Free-standing 튜브와 일회용 소모품을 사용하여 Cross-contamination을 차단합니다.
Q3.데이터 분석 및 시스템 제어를 위한 소프트웨어 환경 및 연동성은 어떻게 되나요?
A.Windows 호환 소프트웨어가 사전 설치된 노트북(Laptop)이 기본 제공되어 손쉽게 파라미터를 설정하고 시스템을 제어할 수 있습니다. 분석 프로필은 Fragment Analyzer 등을 통해 2, 3, 5, 8 kb 등 설정된 타겟 크기별 결과를 명확히 확인해 검증할 수 있습니다.
제품 사양
| Fragment Length Range Achievable | 2 kb ~ 75 kb (기본 3 kb ~ 75 kb) |
|---|---|
| Sample Volumes Accepted | Minimum 50 μl, Maximum 400 μl (Recommended 200 μl) |
| Sample Concentration | 0 ~ 50 ng/μl (Recommended 200 ng/μl) |
| Throughput | Two samples processed in series |
| Time per sample | 10 ~ 20 min (including sample processing and system washing) |
| Tubes | 0.5 ml free-standing, provided |
| Control Software | Windows compatible, pre-installed on included laptop |
| Main Unit Dimensions | 67(w) x 218(d) x 255(h) mm |
| Total Weight | 8 kg |